Na ausência de oxigênio, toda a matéria orgânica é passiva de biodigestão, fenômeno também conhecido como decomposição anaeróbia. Podemos dizer que a biodigestão é uma reciclagem natural, onde as moléculas maiores serão quebradas até se tornarem moléculas menores se apresentando então como fase líquida e fase gasosa.
Na fase gasosa temos então o biogás. O biogás é composto basicamente de Metano e Gás carbônico. Dependendo da biomassa (substrato) usada no processo de biodigestão, podemos ter maior ou menor geração de biogás com diferentes concentrações de metano e gás carbônico.